萤石来自火山岩浆中，在岩浆冷却过程中，被岩浆分离出来的气水溶液中含有许多物质，以氟为主，在溶液沿裂隙上升过程中，温度降低，压力减小，气水溶液中的氟离子与周围岩石中的钙离子结合，形成氟化钙，经过冷却结晶后就得到了萤石。

　　为花岗岩、伟晶岩、正长岩的副矿物，在火山周边的喷气孔也可以发现萤石。也产自碳酸岩和碱性侵入岩中。沉积于热液矿脉及层控矿床中。在砂岩的自然衔接处萤石会产生粘合剂的作用。

　　多数结晶为八面体和立方体，少见十二面晶体。也有八面体和立方体相交而成的组合晶体，在此条件下也可能生成结构复杂的十二面结晶。解理痕迹在多数晶体上有呈现，从较大晶体上剥落的解理块也很常见。

　　在八面体结晶下，解理块较扁平、呈三角形;立方晶体的解理块为扁的长方体。萤石的晶体往往出现穿插双晶，即两个晶体相互贯穿所构成的双晶现象。也有团簇而成的共生立方晶体，或为颗粒状、葡萄状、球状或不规则大块。